평범한 남학생 쿈은 입학 첫날 독특한 자기소개를 하는 하루히의 앞자리에서 고교 생활의 첫 스타트를 끊는다. 하루히는 평범함은 곧 우울이라는 좌우명으로 “세상을 업 시키기 위한 스즈미야 하루히 단”을 약자로 한 “SOS단”을 만들고 단지 앞자리에 앉았다는 이유만으로 쿈을 창립 멤버로 뽑는다. 불가사의하고 황당한 사건들을 찾아 다니고 직접 엉뚱한 일을 만들어내는 것이 주요활동인 SOS단. 쿈을 비롯한 단장 스즈미야의 독단에 가입하게 된 단원들은 ‘스즈미야 하루히’가 저지르는 사고에 하루가 멀다 하고 시달리지만 시간이 갈수록 점점 적응해 나가고 어느새 겨울방학, 스즈미야 하루히가 이끄는 SOS단원들은 전과 다름 없이 학교 생활을 보내며 다가오는 크리스마스 이브에 부실에서 파티를 열 계획을 세우고 있었다.
